Мысль о создании в Шлиссельбурге краеведческого музея впервые возникла в довоенные годы. По воспоминаниям жителей довоенного Шлиссельбурга, в частности Н.В. Селюгина, Краеведческий музей в Шлиссельбурге существовал до Великой Отечественной войны в клубе, который стоял на месте нынешнего КСК «Невский». Информация о существовании Краеведческого музея в городе до войны подтверждается и «Актом о кровавых преступлениях разрушительной деятельности грабежах и насилиях гитлеровцев в городе Шлиссельбурге» от 20 февраля 1943 г., хранящемся в фондах нашего музея. «Полному разгрому подверглись культурные учреждения: исторический музей, два клуба, три библиотеки, городской кинотеатр…». Таким образом, первый краеведческий музей в Шлиссельбурге был разрушен во время оккупации города.
Музей истории города Шлиссельбурга
После войны в 1959 году по инициативе жителей был создан Краеведческий музей при Городской библиотеке на ул. Жука. Работники библиотеки К.С. Леонидова, С.Г. Кузнецова, М.Е. Митрофанов собирали материалы и воспоминания жителей. В результате ремонта здания на ул. Жука, библиотека вместе с фондами краеведческого отдела переехала в Никольскую церковь.
7 мая 1985 года открывается музей-диорама «Прорыв блокады Ленинграда» и большинство предметов из краеведческого отдела библиотеки перешли в фонды вновь созданного музея-диорамы.
Однако жители города не оставляли надежды иметь свой краеведческий музей и 04.07.1985 года Исполнительным комитетом Кировского городского Совета народных депутатов Ленинградской области было принято решение о создании историко-краеведческого музея в г. Петрокрепости (Решение № 282) «…создать на базе зданий бывшей Никольской церкви, бывшего Благовещенского собора, бывшей часовни г. Петрокрепости — историко-краеведческий музей. Невскому Судостроительному Судоремонтному Заводу предписано «в I полугодии 1986 года перевести городскую библиотеку из здания бывшей Никольской церкви в Дом Молодёжи».
После решения Исполнительного комитета Кировского городского Совета народных депутатов Ленинградской области от 04.07.1985 Музей планируется открыть в здании благовещенского собора и Никольской церкви. Библиотеку переводят в новое здание, а помещения в Никольской церкви освобождаются. С 1986 года музей располагается в здании Никольской церкви. Поиск экспонатов вновь начала Н.Н. Трофимова, в последующем директор музея.
Во исполнении решения № 282 и Леноблисполкома № 7 от 1988 года просили включить в план научной работы сотрудников филиала крепость «Орешек» совместную работу по подготовке временной выставки «Страницы истории города Шлиссельбурга». Эту выставку планируется открыть в I–II квартале 1990 г. в помещении бывшей Никольской церкви города Петрокрепости; (письмо от дирекции музеев Ленинградской области).
Но 19 октября 1989 года Исполнительным комитетом Кировского городского Совета народных депутатов принято решение № 791 от 14.12.89 о передаче религиозному обществу Русской православной церкви культовых зданий на Красной площади г. Петрокрепости.
18 июня 1990 года выходит Решение президиума Петрокрепостного городского исполнительного комитета народных депутатов «О создании историко-краеведческого музея в г. Петрокрепость» «Во исполнение решения Леноблисполкома № 7 от 18.01.88г. «О мерах по ускорению социального развития и воссоздания историко-архитектурного центра г. Петрокрепости» президиум Петрокрепостного городского Совета решил:
1. Организовать в городе Петрокрепость историко-краеведческий музей
2. Просить управление культуры Леноблисполкома включить музей в состав Объединения музеев Ленинградской области на правах филиала и укомплектовать штатами в установленном порядке…». 18.06.1990 Президиум Петрокрепостного городского исполнительного комитета вновь указывает на необходимость создания музея.
В 1992 году, решение о месте расположения музея все еще не принято, предлагается здание конца 19 века по адресу: улица Жука дом № 1. Но поскольку дом занят различными государственными учреждениями и нуждается в капитальном ремонте, речь об открытии музея пока не идет, как сообщает в газете «Ладога» за апрель 1992 года Н.Н. Трофимова.
В это время краеведческий музей работает совместно с заводским музеем.
Первую выставку удалось открыть только в 1995 году в помещениях ДК «Невский». После длительных переговоров, начатых в 1995 году, музею было передано здание бывшей проходной ситценабивной фабрики на Фабричном острове, д.2А. После окончания ремонта в 2005 музей переехал в это здание.
Актом № 1 от 21 февраля 1995 года подтверждается, что комиссия в составе сотрудников ОМЦ и Народного музея НССЗ, созданная приказом ОМЦ № 442 от 20.12.1994 года, провела натурное освидетельствование и составила коллекционные описи музейных предметов, принадлежащих Народному музею НССЗ для передачи на постоянное хранение в Музей истории города Шлиссельбурга. (документы находятся в музее).
23 февраля 1995 года было разработано положение о Музее истории г. Шлиссельбурга как филиала Государственной организации культуры «Областной музейный центр».
Переехал музей на Фабричный остров в 2005 году.
Целью деятельности шлиссельбургского музея является изучение, сохранение и пропаганда памятников материальной и духовной культуры, связанных с историей Шлиссельбурга. Основная задача музея — сбор, хранение, реставрация и исследование памятников истории и культуры, экспозиционно-выставочная деятельность, просветительская и массовая работа среди населения и гостей города, содействие системе школьного образования, сохранение и реставрация здания на Фабричном острове, дом № 2 А.
В музейном здании площадью 110 кв. м. сегодня располагается фондохранилище, выставочный зал, небольшая экспозиция, рабочие кабинеты сотрудников. Здесь же проходят конференции, мероприятия, образовательные программы.
Музей давно нуждался в расширении площади, поэтому долгожданным событием для всех жителей стало известие о передаче музею бывшего дома Н.Пресмана, где ранее располагалась часовая мастерская, на улице Жука, 7 (ранее — улица Благовещенская).
После окончания реставрационных работ в здании на ул. Жука, 7 в составе музея будут два здания.
Старое здание, на Фабричном острове 2А, будет отдано под экспозицию, посвященную индустриальному наследию города — деятельности важнейших шлиссельбургских предприятий, ситценабивной фабрики (1763–1941 гг.), одной из первых в России фабрик по набойке рисунка на ткань, и Невского судостроительно-судоремонтного завода, а также фонды этих предприятий.